Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R2Q9NY27 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms