Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms