Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCLQ9NW38 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms