Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3EQ9NVU0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms