Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO28Q9NVF7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms