Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNNM1Q9NRU3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms