Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX9Q9NQ69 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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