Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms