Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms