Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PUS3Q9BZE2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms