Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIFKQ9BYG3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms