Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF17Q9BXT8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF17Q9BXT8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms