Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYCP2Q9BX26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP2Q9BX26 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms