Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF23Q9BUL5 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms