Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDC1Q9BTX1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms