Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD2Q9BTF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms