Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms