Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT17Q9BSW7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms