Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GINS3Q9BRX5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms