Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms