Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY1Q96T51 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY1Q96T51 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms