Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3AQ96ST3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms