Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHF1Q96S99 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLEKHF1Q96S99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms