Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A2Q96QD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms