Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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