Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms