Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms