Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCHS1Q96JQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCHS1Q96JQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms