Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CELF6Q96J87 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms