Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC97Q96F63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms