Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP3Q96DZ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms