Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXPE2Q96DL1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms