Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFHD2Q96C19 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms