Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKL1Q969V6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms