Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO1Q92973 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms