Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms