Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RGP1Q92546 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RGP1Q92546 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms