Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMPDL3AQ92484 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMPDL3AQ92484 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms