Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATAD2BQ8WXI9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATAD2BQ8WXI9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms