Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms