Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms