Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF1Q8N6C5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms