Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms