Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC2Q8N158 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms