Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHA9Q7RTU4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms