Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST3Q7LGC8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms