Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HECW1Q76N89 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms