Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC80Q76M96 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms