Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MED13LQ71F56 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms