Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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